La dueña original de la propiedad de The Fillmore, Emma Gates Butler, contrató a James W. y Merritt Reid en 1910 para que dibujaran los planos de un salón de baile de estilo italiano en la esquina suroeste de Fillmore y Geary. El Majestic Hall y la Majestic Academy of Dancing abrieron sus puertas en 1912 en el segundo y tercer piso del edificio, donde se celebraban fiestas los miércoles por la noche y bailes de máscaras.
El Fillmore fue un salón de baile que funcionó bajo varios nombres y gestiones -The Get Acquainted Society, Ambassador Dance Hall- durante la década de 1930, y una pista de patinaje durante la década de 1940. En 1952, el empresario local Charles Sullivan comenzó a contratar a algunos de los nombres más importantes de la música negra en The Fillmore. Sullivan reservó giras por la Costa Oeste para artistas como James Brown, Bobby ‘Blue’ Bland e Ike & Tina Turner. Durante las décadas de 1950 y 1960, San Francisco se ganó la reputación de ser la comunidad bohemia por excelencia en Estados Unidos. Esta reputación nunca fue más merecida que a mediados de los años sesenta, cuando el hipster del movimiento Beat se convirtió en el hippie de una contracultura más dominante. En los años 50, la escena literaria de North Beach había dado paso a la emergente Haight-Ashbury, y la política radical tenía un hueco al otro lado de la Bahía, en la Universidad de California en Berkeley. La línea que separa la cultura de la política es fácilmente difuminada por los jóvenes en busca de aventuras. En la búsqueda de diversión y comunidad, los bailes públicos se pusieron de moda en 1965. Con Ken Kesey liderando su banda de Merry Pranksters hasta los límites de la realidad, y la Family Dog organizando conciertos de baile en el Longshoremen’s Hall, San Francisco iba camino de convertirse en la capital mundial de la moda.
Bill Graham era un veterano de la comunidad artística, pero sus mayores talentos eran su aguda visión empresarial y su capacidad para organizar eventos, creando atmósferas cómodas y seguras sin sofocar las energías creativas que le rodeaban. Manteniendo un alto nivel estético y recurriendo a una energía personal ilimitada, Bill reunió a un equipo de trabajo que funcionaba como una familia, y fue una fuerza primordial en la floreciente escena de San Francisco.
El Fillmore representó la cúspide de la creación musical a finales de la década de 1960. Desde el 10 de diciembre de 1965, cuando Bill Graham produjo una gala benéfica de la compañía San Francisco Mime (Jefferson Airplane con Great Society y Mystery Trend; los Warlocks, más tarde los Grateful Dead, dieron el pistoletazo de salida al espectáculo), hasta el 4 de julio de 1968, el público de The Fillmore experimentó un renacimiento musical y cultural de dos años y medio que produjo parte de la música más innovadora y emocionante que jamás haya salido de San Francisco. Las carreras de Grateful Dead, Jefferson Airplane, Santana, Quicksilver Messenger Service, Big Brother and the Holding Company, Moby Grape, Butterfield Blues Band y muchos otros se iniciaron en el escenario del Fillmore. El talento musical más importante del momento ha aparecido allí: Jimi Hendrix, Otis Redding, Cream, Howlin’ Wolf, Captain Beefheart, Muddy Waters, The Who… bueno, ya te haces una idea. O has escuchado las historias. Si tienes suerte, estuviste allí.
El Fillmore se convirtió en un club de barrio privado durante un tiempo en la década de 1970, y a principios de la década de 1980, Paul Rat produjo espectáculos en el edificio (apodado Elite Club) con Black Flag, Bad Brains, The Dead Kennedys, T.S.O.L., Flipper, Public Image Ltd. y otros. Bill Graham Presents produjo algunos eventos en el edificio en la década de 1980, incluida la fiesta del 20º aniversario de la empresa, y filmó allí un especial musical de HBO Fillmore. En 1987, los propietarios Bert y Regina Kortz contrataron a Michael Bailey para que empezara a producir espectáculos en The Fillmore. El primer espectáculo fue el de Husker Du el 29 de abril de 1987. Pero Bill siempre tuvo un lugar especial en su corazón para el primer lugar en el que hizo espectáculos. El 3 de marzo de 1988, volvió al Fillmore original con un espectáculo en el que actuó el grupo de reggae africano Alpha Blondy & The Solar System y Little Women.
El Fillmore reabrió el 27 de abril de 1994 con The Smashing Pumpkins, Ry Cooder & David Lindley y American Music Club. Las entradas para el espectáculo se agotaron en menos de un minuto. Linda Perry, ex integrante de 4 Non-Blondes, abrió el espectáculo con un set sorpresa que incluía una versión de ‘Whole Lotta Love’ de Led Zeppelin.’
El cartel del mes de apertura del Fillmore incluía a Primus, Chris Isaak, Michelle Shocked, The Afghan Whigs & Redd Kross, Queen Latifah y Solsonics, Gin Blossoms, Jimmie Dale Gilmore y Marshall Crenshaw, ¡D’Cuckoo y Pele Juju, Sir Douglas Quintet y The Hellecasters, Brian Setzer Orchestra, Mother Hips, Ali Farka Toure y Ben Harper, Huey Lewis and the News, NRBQ, Blues Traveler y Soul Hat, They Might Be Giants y Frente!, Counting Crows, Thinking Fellers Union Local #282, Steel Pole Bathtub y SF Seals, Twister – A Ritual Reality, interpretado por Ken Kesey y los Merry Pranksters con música de Jambay, Jefferson Starship y Merl Saunders
A lo largo de la década transcurrida desde que el club celebró su reapertura, la calidad, la variedad y el número de espectáculos celebrados en él han sido asombrosos. El premio a la mayor cantidad de apariciones sería para Tom Petty and the Heartbreakers, que han tocado un total de 27 veces en The Fillmore; la primera fue una maratón de 20 espectáculos; la segunda, unas escasas 7 noches. Los Lobos se presentan todos los años en diciembre; Willie Nelson y Lucinda Williams parecen tener debilidad por el Fillmore. No Doubt, Radiohead, The Cure, Sonic Youth, Prince, The White Stripes, Dave Chappelle e incluso Tom Jones han pasado por el escenario varias veces.