Samuel Parris, fils de Thomas Parris, est né à Londres, en Angleterre, dans une famille à la réussite financière modeste et non-conforme à la religion. Samuel a immigré à Boston au début des années 1660, où il a fréquenté le Harvard College à la demande de son père. À la mort de son père en 1673, Samuel quitte Harvard pour reprendre son héritage à la Barbade, où il entretient une plantation de sucre.
En 1680, après qu’un ouragan ait frappé la Barbade, endommageant une grande partie de ses biens, Parris vend une partie de ses terres et retourne à Boston, où il fait venir son esclave Tituba et épouse Elizabeth Eldridge. Eldridge était considérée par beaucoup comme incroyablement belle, et on disait qu’elle était l’une des plus belles femmes de Salem Village. Ensemble, ils ont eu trois enfants, Thomas Parris, Elizabeth Parris et Susannah Parris. Bien que la plantation soutienne ses entreprises commerciales, Parris n’est pas satisfait de son manque de sécurité financière et commence à se tourner vers le ministère. En juillet 1689, il devient ministre de Salem Village (aujourd’hui Danvers), Massachusetts.
Salem Village était un lieu de vie litigieux et était connu pour être querelleur par les villes et villages voisins. Son modèle de colonisation dispersée peut avoir entraîné un manque de sens de l’objectif commun qui aurait pu unir des communautés plus ordonnées et organisées. Parris était le quatrième ministre nommé dans une série de tentatives infructueuses pour conserver un ministre permanent. James Bayley (1673-79) et George Burroughs (1680-83) ne sont restés que quelques années chacun, et sont partis après que la congrégation n’ait pas payé leurs pleins tarifs. Deodat Lawson (1684-88) part avec moins de contestation. D’autres tensions sont causées par le retard de Parris à accepter le poste et son incapacité à résoudre les différends de ses paroissiens. Il y a également des différends concernant la rémunération de Parris. En octobre 1691, la ville décide de ne plus lui verser son salaire. Ces problèmes, et d’autres plus personnels entre les villageois, continuèrent à croître sans relâche.
Les événements qui conduisirent aux procès des sorcières de Salem commencèrent lorsque la fille de Parris, Betty, et sa cousine, Abigail Williams, accusèrent Tituba, l’esclave de Parris, de sorcellerie. Parris a battu Tituba jusqu’à ce qu’elle s’avoue sorcière, et John Indian, son mari, a commencé à accuser les autres. Le délire s’est répandu, de nombreuses personnes ont été appréhendées, dont la plupart ont été emprisonnées. Pendant la durée de 16 mois du phénomène des procès de sorcières de Salem, 19 personnes ont été pendues, et une, Giles Corey, a été pressée à mort.
Lors d’un sermon de 1692, Parris a déclaré que « comme dans notre texte il y en avait un parmi les 12… ainsi dans nos églises Dieu sait combien de Diables il y a », encourageant les villageois antagonistes à localiser et à détruire les « sorcières » qui, comme il se trouve, étaient fréquemment des individus avec lesquels Parris et ses principaux alliés, la famille Putnam, avaient pris ombrage.
Comme Parris avait été un procureur actif dans les affaires de sorcellerie, en 1693, sa paroisse a porté plainte contre Parris pour son rôle dans les procès. Parris s’est excusé dans son essai Méditations pour la paix, qu’il a présenté en novembre 1694. Increase Mather dirigea un conseil d’église qui lui donna alors raison.
Parris fut ensuite impliqué dans un conflit avec sa congrégation au sujet d’un terrain de presbytère qu’il avait saisi pour se dédommager du salaire qui lui était dû. Le litige se retrouve devant un tribunal d’Ipswich qui, en 1697, ordonne le paiement de son salaire et la restitution du terrain. En 1696, cependant, il avait trouvé sa situation intenable. Il démissionne cette année-là et quitte Salem. Les enregistrements dans les Suffolk Deeds indiquent qu’il est probablement revenu aux affaires à Boston en 1697.
Sa femme Elizabeth est décédée en 1696. En 1699, il se remarie, avec Dorothy Noyes, à Sudbury. Il prêche pendant deux ou trois ans à Stow. Il déménage ensuite à Concord (1704/05). Il prêche également six mois à Dunstable en 1711. Il meurt le 27 février 1720, à Sudbury.