En 1900, Franz Eduard Suess a fait remarquer que les moldavites de la taille d’un gravier présentaient de curieux pittings et rides à la surface, qui ne pouvaient être dus à l’action de l’eau, mais ressemblaient aux marques caractéristiques de nombreuses météorites. Il attribua ce matériau à une origine cosmique et considéra les moldavites comme un type particulier de météorite pour lequel il proposa le nom de téktite. En raison de leur difficile fusibilité, de leur teneur en eau extrêmement faible et de leur composition chimique, le consensus actuel parmi les spécialistes de la terre est que les moldavites se sont formées il y a environ 14,7 millions d’années lors de l’impact d’une météorite géante dans l’actuel cratère Nördlinger Ries. Les éclaboussures de matière fondue par l’impact se sont refroidies pendant qu’elles étaient en suspension dans l’air et la plupart sont tombées en Bohême. Actuellement, des moldavites ont été trouvées dans une région qui comprend le sud de la Bohême, la Moravie occidentale, le bassin de Cheb (nord-ouest de la Bohême), la Lusace (Allemagne) et le Waldviertel (Autriche). Des analyses isotopiques d’échantillons de moldavites ont montré une composition isotopique en béryllium-10 similaire à celle des tektites australasiennes (australites) et des tektites de Côte d’Ivoire (ivorites).
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Nety-nine percent of all moldavite finds have come from the South Bohemian localities, one percent were found in South Moravian localities. Seules quelques dizaines de pièces ont été trouvées dans la région de la Lusace (près de Dresde), dans la région du bassin de Cheb (Bohême occidentale) et dans le nord de l’Autriche (près de Radessen). Les principales occurrences de moldavites en Bohême sont associées aux sédiments tertiaires des bassins de České Budějovice et de Třeboň. Les localités les plus importantes sont concentrées dans une bande NW-SE le long de la marge occidentale du bassin de České Budějovice. La majorité de ces occurrences sont liées au membre de Vrábče et au gravier sableux de Koroseky. Des localités importantes du bassin de Třeboň sont liées aux graviers et aux sables de la formation de Domanín.
En Moravie, les occurrences de moldavite sont limitées à une zone grossièrement délimitée par les villes de Třebíč, Znojmo et Brno. La couleur des moldavites de Moravie diffère généralement de leurs homologues de Bohème, car elle tend à être brunâtre. Si l’on tient compte du nombre de pièces trouvées, les localités de Moravie sont nettement moins productives que celles de Bohême ; cependant, le poids moyen des moldavites trouvées est beaucoup plus élevé. Les sédiments moldavites les plus anciens (primaires) se trouvent entre Slavice et Třebíč. La majorité des autres localités de Moravie méridionale sont associées à des sédiments de rivières miocènes ainsi que pléistocènes qui traversaient cette région plus ou moins vers le sud-est, à l’instar des cours d’eau actuels de Jihlava, Oslava et Jevišovka.